两家公募基金的高管都认为，目前恒生电子的系统稳定，为大部分公募基金采用，而且这些系统上往往有各基金的历史数据，所以不会因为恒生电子更换了大股东就换一个系统，除非是确认恒生电子为大股东谋取不正当利益。但是，“如果恒生电子真这样做，那不要说我们，证监会先要去找他们。”
但一家公募基金的后台人员表示出他的担忧。“公募基金不但使用恒生的交易系统，还使用资金清算系统，恒生还做份额的注册交易。公募基金使用恒生这些系统的比例也很高。”简言之，如果恒生电子将这些数据放到一起，可以看到很多公募基金客户的交易记录，据此分析客户的交易行为，这就是最近热门的“大数据”。
上述公募基金后台人员告诉记者，“阿里一定会收购恒生。如果阿里通过恒生的数据获得其他公募基金的交易行为，就算短期看不出什么影响，但长期会有影响。而且我听说有其他互联网新时社司在接洽其他金融软件公司。”他分析认为，这是互联网新时社司进一步侵入金融领域的表现。
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